С 1985 года он активно принимал участие в работе по налаживанию контактов с Кавказскими республиками, казачеством юга России, формированию Конфедерации народов Кавказа, с группой поддержки депутата Верховного Совета СССР Ардзинба выезжал в Москву для формирования необходимых материалов по восстановлению исторической справедливости Абхазии.
В 1992 году он первым откликнулся на попытку оккупации Грузией Южной Осетии, инициировал и выдвинулся в составе абхазского подразделения на помощь братскому народу, там участвовал в боевых действиях вплоть до начала войны в Абхазии.
Грузинских агрессоров встретил на линии Гумиста, поначалу присоединился к Мушни Хварцкия, а после самостоятельно ходил на вылазки, чтобы добыть оружие.
Вместе с сыном они принимали участие в большинстве военных операций, которые были осуществлены абхазскими Вооруженными Силами за весь период войны, хотя Николай Джонуа, после мартовской операции был переведен в Генеральный штаб заместителем военного комиссара.
Он был человеком чести, способным на самопожертвование во имя Победы.
В должности заместителя министра обороны, Николай Таевич принимал активное участие в разработке и планировании стратегических планов Вооруженных Сил.
12 декабря 1994 года он трагически ушел из жизни.
В Абхазии никогда не забудут выдающийся вклад Николая Таевича Джонуа в борьбе за свободу и независимость Абхазии.
Николай Таевич являет собой яркий пример нашего общего духовного и нравственного достояния, неиссякаемый источник национальной гордости, патриотизма.