Прием в вузы Минобороны России организуется в два этапа.

Первый этап (предварительный отбор) проводится в Министерстве обороны, (для военнослужащих – командованием воинских частей).

В ходе него определяется соответствие кандидатов требованиям, установленным законодательством Республики Абхазия для граждан, желающих проходить военную службу по контракту. В том числе по уровню образования, возрасту, состоянию здоровья, профессиональной пригодности. При условии соответствия кандидатов предъявляемым требованиям они к  прохождению профессионального отбора.

В ходе второго этапа (профессиональный отбор) определяется способность кандидатов осваивать образовательные программы высшего образования по соответствующим специальностям. Профессиональный отбор включает: определение годности кандидатов к поступлению в вуз Минобороны России по состоянию здоровья, определение профессиональной пригодности кандидатов, а также вступительные испытания (определение уровня общеобразовательной подготовленности кандидатов и оценку уровня физической подготовленности). Зачисление в вузы Минобороны России осуществляется на конкурсной основе.